Η αρχή λειτουργίας της σάουνας βρίσκεται στη μεταβολή ξηρού, ζεστού και κρύου αέρα. Έτσι ο οργανισμός μπορεί να αντέξει τις υψηλές θερμοκρασίες που αναπτύσσονται στη σάουνα 60°C-100°C . Γιατί η υγρασία του αέρα που κυκλοφορεί είναι πολύ μικρή (περίπου 30%).

Όταν μπαίνουμε στη σάουνα ανεβαίνει η θερμοκρασία του σώματός μας, ενεργοποιείται ο οργανισμός μας και παράγει αυτόματα αντισώματα. Το αποτέλεσμα είναι η σκληραγώγηση και η μεγαλύτερη αντίσταση στα μικρόβια. Επίσης με την υψηλή θερμοκρασία και υγρασία έχουμε μεγάλη εφίδρωση, έτσι αποβάλλονται οι άχρηστες ουσίες του οργανισμού (δηλ. τοξίνες) και το σώμα μας μετά από μία έντονη μυϊκή προσπάθεια ξεκουράζεται και χαλαρώνει.

Στη συνέχεια αμέσως μετά την έξοδό μας από τη σάουνα και ερχόμενοι σε επαφή με το κρύο νερό (ντους) φέρνουμε τη θερμοκρασία του σώματός μας στη φυσιολογική κατάσταση διότι συστέλλονται τα αιμοφόρα αγγεία και παράλληλα το αίμα οξυγονώνεται με αποτέλεσμα τη σταθεροποίηση της λειτουργίας του κυκλοφορικού συστήματος